Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA4Q8WW22 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms