Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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