Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms