Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q8

COX18, Mitochondrial inner membrane protein COX18, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX18Q8N8Q8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COX18Q8N8Q8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms