Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms