Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms