Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms