Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms