Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms