Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms