Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO38Q6PIJ6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms