Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms