Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSMD4Q5XG99 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms