Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms