Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDSS1Q5T2R2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms