Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms