Protein–RNA interactions for Protein: Q53H64

LINC00483, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00483, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00483Q53H64 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00483Q53H64 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
LINC00483Q53H64 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00483Q53H64 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00483Q53H64 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00483Q53H64 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00483Q53H64 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00483Q53H64 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00483Q53H64 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00483Q53H64 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00483Q53H64 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms