Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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RNF212Q495C1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RNF212Q495C1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RNF212Q495C1 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RNF212Q495C1 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RNF212Q495C1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RNF212Q495C1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RNF212Q495C1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RNF212Q495C1 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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