Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms