Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms