Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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ZNF827Q17R98 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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ZNF827Q17R98 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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ZNF827Q17R98 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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ZNF827Q17R98 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
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ZNF827Q17R98 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF827Q17R98 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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ZNF827Q17R98 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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ZNF827Q17R98 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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ZNF827Q17R98 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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ZNF827Q17R98 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF827Q17R98 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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