Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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