Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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