Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PCSK7Q16549 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK7Q16549 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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