Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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