Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms