Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SMCO1Q147U7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SMCO1Q147U7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SMCO1Q147U7 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SMCO1Q147U7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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