Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM29Q14134 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM29Q14134 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM29Q14134 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM29Q14134 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM29Q14134 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM29Q14134 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM29Q14134 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms