Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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CKAP5Q14008 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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CKAP5Q14008 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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CKAP5Q14008 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
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CKAP5Q14008 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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CKAP5Q14008 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CKAP5Q14008 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CKAP5Q14008 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CKAP5Q14008 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CKAP5Q14008 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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