Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms