Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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DDX39BQ13838 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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DDX39BQ13838 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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DDX39BQ13838 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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DDX39BQ13838 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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DDX39BQ13838 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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DDX39BQ13838 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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DDX39BQ13838 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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DDX39BQ13838 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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DDX39BQ13838 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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