Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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LSAMPQ13449 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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LSAMPQ13449 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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LSAMPQ13449 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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LSAMPQ13449 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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LSAMPQ13449 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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LSAMPQ13449 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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LSAMPQ13449 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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LSAMPQ13449 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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LSAMPQ13449 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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LSAMPQ13449 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LSAMPQ13449 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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