Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP140Q13342 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP140Q13342 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP140Q13342 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP140Q13342 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP140Q13342 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP140Q13342 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP140Q13342 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP140Q13342 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SP140Q13342 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP140Q13342 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP140Q13342 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP140Q13342 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP140Q13342 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP140Q13342 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP140Q13342 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP140Q13342 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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