Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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CALCOCO2Q13137 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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CALCOCO2Q13137 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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CALCOCO2Q13137 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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CALCOCO2Q13137 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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CALCOCO2Q13137 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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CALCOCO2Q13137 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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