Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms