Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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