Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM32Q13049 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms