Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms