Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK18Q07002 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms