Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNDQ07001 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNDQ07001 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms