Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms