Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALD1Q05682 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALD1Q05682 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CALD1Q05682 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CALD1Q05682 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CALD1Q05682 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALD1Q05682 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALD1Q05682 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CALD1Q05682 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CALD1Q05682 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALD1Q05682 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms