Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms