Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms