Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms