Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms