Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMF1P82094 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMF1P82094 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMF1P82094 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMF1P82094 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms