Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBA1P69905 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBA1P69905 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBA1P69905 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBA1P69905 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBA1P69905 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBA1P69905 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBA1P69905 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBA1P69905 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBA1P69905 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBA1P69905 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms