Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms