Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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SPCS3P61009 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SPCS3P61009 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SPCS3P61009 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SPCS3P61009 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SPCS3P61009 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SPCS3P61009 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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SPCS3P61009 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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